- Отдел Античного мира
- Отдел Археологии Восточной Европы и Сибири
- Отдел Востока
- Отдел западноевропейского изобразительного искусства
- Отдел западноевропейского прикладного искусства
- Отдел Истории русской культуры
- Отдел нумизматики
- Отдел «Арсенал»
- Отдел «Музей Императорского фарфорового завода»
- Отдел Современного искусства
- Отдел «Дворец Меншикова»